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Biomedical Event Trigger Identification Using Bidirectional Recurrent Neural Network Based Models

机译:使用双向递归识别生物医学事件触发器   基于神经网络的模型

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摘要

Biomedical events describe complex interactions between various biomedicalentities. Event trigger is a word or a phrase which typically signifies theoccurrence of an event. Event trigger identification is an important first stepin all event extraction methods. However many of the current approaches eitherrely on complex hand-crafted features or consider features only within awindow. In this paper we propose a method that takes the advantage of recurrentneural network (RNN) to extract higher level features present across thesentence. Thus hidden state representation of RNN along with word and entitytype embedding as features avoid relying on the complex hand-crafted featuresgenerated using various NLP toolkits. Our experiments have shown to achievestate-of-art F1-score on Multi Level Event Extraction (MLEE) corpus. We havealso performed category-wise analysis of the result and discussed theimportance of various features in trigger identification task.
机译:生物医学事件描述了各种生物医学实体之间的复杂相互作用。事件触发是通常表示事件发生的单词或短语。事件触发识别是所有事件提取方法中重要的第一步。但是,当前的许多方法要么依赖于复杂的手工特征,要么仅考虑窗口中的特征。在本文中,我们提出了一种利用递归神经网络(RNN)的优势来提取整个句子中存在的高级特征的方法。因此,RNN的隐藏状态表示以及词和实体类型的嵌入作为特征避免了依赖使用各种NLP工具包生成的复杂的手工特征。我们的实验表明,可以在多级事件提取(MLEE)语料库上获得最新的F1分数。我们还对结果进行了类别分析,并讨论了各种特征在触发器识别任务中的重要性。

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